首先，我们看看发票种类：
增值税发票分为增值税专用发票、机动车销售统一发票、普通发票三个大类。可见，机动车专用发票是针对汽车销售专门定制的一种发票，没有增值税专票和普票之分。机动车销售统一发票是增值税发票里的一种。
机动车销售过程中一般不会开具增值税普通发票。机动车销售过程中，如果是生产厂商销售给汽车4s店，开具的是增值税专用发票；不管是生产厂商还是4s店，销售给消费购买者，都需要开具机动车销售统一发票。
如果购买者是一般纳税人，则发票上填写其税号，凭机动车发票可抵扣进项税额，如果是个人或小规模纳税人，则填写身份证号或企业的组织机构代码证号，这时，机动车销售统一发票不能做进项抵扣。
最关健的区别是，机动车销售统一发票除了发票联和抵扣联外，还有办理汽车牌照、行驶证使用的联次，而增值税普通发票和增值税专用发票都没有这样的联次，不能上牌办证。
其次，我们看看政策依据：
《国家税务总局关于使用新版机动车销售统一发票有关问题的通知》〔国税函〔2006〕479号〕规定：“凡从事机动车零售业务的单位和个人，从2006年8月1日起，在销售机动车（不包括销售旧机动车）收取款项时，必须开具税务机关统一印制的新版《机动车销售统一发票》（以下简称《机动车发票》），并在发票联加盖财务专用章或发票专用章，抵扣联和报税联不得加盖印章。”
《国家税务总局关于〈机动车销售统一发票〉注册登记联加盖开票单位印章问题的通知》〔国税函〔2006〕813号）规定：“从2006年10月1日起，《机动车销售统一发票》注册登记联一律加盖开票单位印章。
第三，我们看看发票样式：
机动车销售发票，为电脑六联式发票。即第一联发票联（购货单位付款凭证），第二联抵扣联（购货单位扣税凭证），第三联报税联（车购税征收单位留存），第四联注册登记联（车辆登记单位留存），第五联记账联（销货单位记账凭证），第六联存根联（销货单位留存）。第一联印色为棕色，第二联印色为绿色，第三联印色为紫色，第四联印色为蓝色，第五联印色为红色，第六联印色为黑色。发票代码、发票号码印色为黑色。机动车销售发票规格为241mm×177mm。当购货单位不是增值税一般纳税人时，第二联抵扣联由销货单位留存。
