审计报告是申请高新技术企业的必备材料。近三年的年度审计报告，两个专项审计报告，一共五套报告是必备材料。
出具的报告需要注意的事项如下:
1.三表一致。利润表，纳税申报表，研发费专审报告上披露的研发费必须一致。
2.高新收入专审报告披露的高新技术产品销售收入占主营收入的比重＞60%
3.研发费专审报告披露的人员工资，需要有凭证支撑。
另外还需要注意:
1、注意与之前向政府部门申报的资料保持一致
按照原国税函 [2009]203 号文的要求，高新技术企业需要在汇算清缴期间向税务机关报送研究开发费用结构明细表。另外，很多高新技术企业需要按季度、月份向各地科技部门或者园区管委会报送高新企业相关数据。在再次认定或者各类检查中，企业需要重点关注与之前申报数据的一致性，避免出现前后矛盾的情况。
2、注意研发费用与研发项目、知识产权的关联性
高新技术企业各要素之间具有很强的逻辑上的关联性。与知识产权有关的项目，应该在无形资产摊销项下体现。另外，过于庞大的研发项目可以考虑分拆，但是相关费用不能简单的平均分摊，应当有合理的分摊依据。
3、注意跨期研发费用的处理
跨年度的研发项目在核算研发费用时，应密切关注研发费用预算与研发项目验收报告，以合理分摊各年度的研发费用。
