园林绿化是房开企业必不可少的重要环节，属开发成本中的基础设施费用。房企购入绿化苗木属于农产品，农产品销售是免税的，无法取得增值税专用发票，抵扣链条如因此断裂，就会造成进项税流失，加大企业税负。一般的处理方法是：不管从个人、合作社、公司购进苗木，只要取得对方适用于免税政策开具的普通发票，均按发票注明的苗木买价和9%扣除率计算进项税，并在《增值税及附加税费申报表附列资料》(二)第6行填列。
需要说明的是，如果房企从小规模纳税人购进苗木取得3%税率专用发票，并不是按票面税额抵扣进项税，而是按发票金额(即不含税销售额)乘以9%税率计算抵扣。若园林绿化完成后与对方公司发生的养护费用，则不能按照农产品购进计算抵扣进项税。
